Mübadiller misafirhanelerde üç gün kalacaklar ve bu süre içerisinde verilecek olan çay ve sıcak yemek Hilal-i Ahmer ve hayırseverler tarafından karşılanacak. Mümkün olmayan yerlerde mübadillerin iaşeleri hükümetçe tedarik edilecek, misafirhanelerde kalma müddetleri dolan mübadiller iskan mahallelerine sevk edileceklerdir.
Bu misafirhanelerden İstanbul’da açılanlardan en önemlisi Gülhane Misafirhanesi, diğeri ise İplikhane Misafirhanesi idi.
Bunlardan Gülhane Misafirhanesi 2 bin, İplikhane Misafirhanesi ise bin kişilikti. Buraya 250 karyola temin ettiği gibi 12 kurnalı bir de hamam inşa ettirilmiştir. Ayrıca kış yaklaştığı için mübadillerin üşümemeleri için Gülhane Misafirhanesi’ne sobalar kurdurularak yeterli miktarda odun gönderilmiştir. Ayrıca 10 yataklı revir açılmış, burada bir de doktor görevlendirilmiştir.
Bu misafirhanelerin en büyük sorunu su problemiydi. Bu sebeple sonraki ve temizlenmemekten dolayı hastalıkları baş göstermiş, Mübadele ve İskan Müdüriyeti Terkos İdaresi’ne müracaat etmişse de misafirhanenin su sorununa çözüm bulunamamıştı.
Mübadele, İmar ve İskan Vekaleti tarafından iaşe edilen 3 bin 159 mübadil ile bu sayı 9 bin 286 kişiye ulaşmıştır.
Kalikratya’da açılan 300 yataklı misafirhanenin yatak, yorgan, çatal, kaşık, tabak gibi malzemeleri ise ahali tarafından temin edilmiştir. Mübadiller için Güllük İskelesi’nde 300, Bodrum‘da 200, Marmaris‘te 250, Fethiye‘de 500 yataklı misafirhane tesis edilmiştir.
Çanakkale‘de tesis edilen misafirhanede ise 300 yataklı olup, bütün gereçleri tamamlanmış ve kışın yaklaşması sebebiyle burada 20 tane soba kurdurulmuştur.
